期刊简介
中华人民共和国卫生部主管，中华医学会、济宁医学院主办。本刊是国家级学术期刊，为《中文核心期刊要目总览》核心期刊、中国科技核心期刊、中国科学引文数据库期刊、中国科技论文统计源期刊，卫生部优秀期刊、中华医学会优秀期刊、中国期刊协会编校质量优秀期刊和山东省优秀期刊。本刊是亚洲行为医学领域惟一学术期刊，也是中国首份以脑科学命名的学术期刊。适合各级医院医护人员及各类院校师生阅读。
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首页>中华行为医学与脑科学杂志
- 杂志名称：中华行为医学与脑科学杂志
- 主管单位：中华人民共和国国家卫生和计划生育委员会
- 主办单位：中华医学会 济宁医学院
- 国际刊号：1674-6554
- 国内刊号：37-1468/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：中华医学会系列杂志 卫生部优秀期刊期刊收录：上海图书馆馆藏, CA 化学文摘(美), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 维普收录(中), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中), 哥白尼索引(波兰), 剑桥科学文摘, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 万方收录(中)
条件性恐惧记忆相关基因的生物信息学分析
刘欢；顾小萍
关键词：条件性恐惧记忆, 生物信息学, 基因分析, 聚类分析
摘要：目的 利用生物信息学方法对公共基因数据库微阵列表达谱进行分析,确定条件性恐惧记忆的关键基因.方法 从Gene Expression Omnibus(GEO)下载GSE57465微阵列数据,数据分为对照组和实验组(FC_0.5 h组和FC_2 h组).在R软件中通过分位数法对原始数据进行标准化,然后通过芯片数据平台的注释包(illuminaMousev2.db)将探针名称转换为基因名.选用Limma方法筛选对照组和实验组之间的差异表达基因,差异表达基因纳入标准:Padj<0.05,差异倍数>1.5.之后对差异表达基因进行聚类分析,以及GO和KEGG富集分析.构建差异表达基因所翻译的蛋白质之间相互作用(protein-protein interactions,PPI)网络,并选取网络中包含枢纽蛋白的网络模块进行分析,确定网络中的相关枢纽蛋白.结果 初步筛选了47个差异表达基因,其中FC_0.5 h组含有36个差异表达基因;FC_2 h组含有11个差异表达基因.GO和KEGG分析提示差异表达基因主要富集于核糖体,参与核糖体内蛋白合成的信号通路,同时也发挥着正调控RNA聚合酶II启动子转录和翻译的生物学作用.PPI网络分析发现Egr2,Fos,Sgk1三个蛋白质的表达水平显著升高,并在网络中发挥枢纽蛋白的作用.结论 Egr2,Fos,Sgk1可能在条件性恐惧记忆的形成中起重要作用.
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